青霧山百草堂的藥童葉生，三年前被堂主林墨所救，因無法感應靈氣，隻能以凡人之身在此生活。一日，黑風寨匪徒前來搶奪靈泉，林墨雖擊退嘍囉，卻引來寨主趙虎報複。危急關頭，葉生胸口的黑色石頭迸發微光，不僅護住他和林墨，更助他意外突破，成功引氣入體，反敗趙虎，自此踏上修仙路。
林墨隨後帶葉生見識百草堂的靈泉，並傳授他基礎功法《百草訣》。然而平靜並未持續，青雲宗弟子趙磊先是尋釁，後又藉故發難，聯合他人奪取靈泉。林墨為保護葉生和靈泉不幸身亡，葉生雖爆發潛力擊退敵人，但百草堂已毀，隻得帶著師父的遺願逃亡。
逃亡途中，葉生偶遇散修蘇靈兒和曾有過交集的阿木，三人結伴前往流雲城。在流雲城的坊市，葉生因一塊特殊礦石與丹王閣結緣，雖初始隻是雜役弟子，卻憑藉在煉丹上的天賦被李長老看中，得以學習煉丹術。後在丹王閣與萬寶樓的煉丹比試中，葉生以雜役弟子之身出戰，成功煉製上品固元丹，助丹王閣獲勝，也因此被李長老收為正式弟子，在丹道與修為上均穩步提升。
然而變故再生，丹王閣閣主突然失蹤，萬寶樓趁機前來奪權，危急時刻，丹王閣太上長老現身，暫時化解了危機，但閣主失蹤的謎團與潛在的危機仍未解除。