公元2749年，“大寂滅”災難摧毀了太陽係99%的人類文明，僅存的倖存者龜縮在木星軌道的“方舟空間站”和火星地下的“熔岩城”中，依靠殘存的科技苟延殘喘。曾是聯邦首席基因工程師的林越，因一場離奇的實驗事故被流放至輻射遍佈的月球廢墟，卻意外發現了一塊刻有未知符文的外星骸骨——它不僅能修複他受損的基因，更藏著“大寂滅”的真相和重啟文明的密鑰。
當林越帶著秘密重返人類聚居地，卻捲入方舟與熔岩城的資源戰爭、基因覺醒者與普通人類的階級對立，以及隱藏在人類內部的外星觀察者陰謀。他一邊聯合被壓迫的“變異者”群體，破解星骸中的文明代碼，一邊對抗來自星際和人類內部的雙重威脅。從月球廢墟到柯伊伯帶的神秘星門，從基因編輯的戰場到意識互聯的虛擬空間，林越終將揭開人類文明存續的終極答案：是在廢墟上重建舊秩序，還是借星骸之力開啟全新的文明紀元NPLDC